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基于蛋白质晶体结构的残基相互作用势能函数研究进展

孙卫涛

孙卫涛. 基于蛋白质晶体结构的残基相互作用势能函数研究进展[J]. 力学进展, 2011, 41(1): 60-78. doi: 10.6052/1000-0992-2011-1-lxjzJ2009-174
引用本文: 孙卫涛. 基于蛋白质晶体结构的残基相互作用势能函数研究进展[J]. 力学进展, 2011, 41(1): 60-78. doi: 10.6052/1000-0992-2011-1-lxjzJ2009-174

基于蛋白质晶体结构的残基相互作用势能函数研究进展

doi: 10.6052/1000-0992-2011-1-lxjzJ2009-174
详细信息
    通讯作者:

    孙卫涛

  • 摘要: 阐述了基于蛋白质晶体结构的残基势能函数的研究进展, 从平均作用力场势能函数的基本物理假设、势能函数性质和影响势能函数准确性的因素3个方面出发, 分析了导出残基相互作用势能的方法, 给出了残基对之间和3个残基之间的平均作用力势能函数计算过程, 并介绍了残基势能函数在蛋白质结构研究领域的应用. 基于蛋白质晶体结构的残基相互作用势能研究表明, 蛋白质结构稳定是多种作用力相互竞争、相互协调进而达到平衡状态的结果. 未来对于残基团簇及其相互作用网络能量分布的研究, 能够建立介于原子尺度和蛋白质整体结构尺度之间的作用力物理模型, 为蛋白质结构宏观尺度研究提供重要的微观力学机理.

     

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出版历程
  • 收稿日期:  2009-11-27
  • 修回日期:  2010-03-29
  • 刊出日期:  2011-01-25

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